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基于虚拟筛选技术的抗新型冠状病毒药物的初步筛选

我们利用计算机辅助药物设计(computer-aided drug design)、虚拟筛选技术(Virtual screening)和分子动力学模拟技术(molecular dynamic simulation),以新型冠状病毒的突刺蛋白(spike-like protein, S protein)和3CL水解酶Mpro为靶点,使用Autodock vina软件对Drugbank数据库和TCMPS数据库中的两万多个小分子化合物进行分子对接以及分子动力学模拟,已经发现了二十余种与这两个蛋白结合能力较强的小分子抑制剂。这些小分子化合物有希望成为抗新型冠状病毒的潜在药物。